Специальный метод, позволяющий количественно и качественно различить клеточные популяции. В случае выделения стволовых клеток пуповинной крови этот метод позволяет буквально поштучно просчитать стволовые клетки и точно определить их содержание в концентрате стволовых клеток. Поскольку от количества стволовых клеток зависит успех трансплантации, данные проточной цитофлуориметрии являются абсолютно необходимыми для характеристики образца. Применение проточной цитофлуориметрии предписано существующими международными и Российскими нормативными документами, регламентирующими работу банков стволовых клеток.