Первые стволовые клетки в организме возникают при развитии эмбриона. Развитие эмбриона начинается со слияния яйцеклетки и сперматозоида. При естественном или искусственном оплодотворении воспринявшая сперматозоид яйцеклетка (зигота) начинает делиться. Развитие эмбриона начинается с формирования первых "преэмбриональных" многоклеточных структур. В начале развития эмбрион имеет шарообразную форму, и в зависимости от числа клеток называется морулой, бластулой, гаструлой, бластоцистой и так далее. Бластоциста формируется через несколько дней после оплодотворения. На стадии бластоцисты эмбрион состоит примерно из 150 клеток, и в нем отчетливо различаются 2 слоя. Поверхностный - из которого в последующем формируется плацента, и внутренний - стволовые клетки. Именно эти, эмбриональные стволовые клетки, при своей дальнейшей дифференциации образуют все виды клеток человеческого организма.